一、 實驗儀器與試劑
表格一:實驗儀器
儀器名稱  | 型號  | 生產(chǎn)廠家  | 
低溫高速離心機  | 64R  | BECKMAN  | 
PCR 儀  | 9700  | ABI  | 
熒光定量 PCR 儀  | 7500  | ABI  | 
儀器  | 廠家  | 型號  | 
小型垂直電泳槽  | Biorad  | 164-8001  | 
轉(zhuǎn)印槽  | Biorad  | Trans-Blot  | 
脫色搖床  | 常州澳華  | TY-80B  | 
電泳儀  | 上海天能  | EPS-200  | 
低溫高速離心機  | 64R  | BECKMAN  | 
酶標(biāo)儀  | Thermo  | Thermo Scientific Microplate Reader  | 
表格二:試劑
試劑名稱  | 廠家  | 
PBS (0.01M, pH 7.4)  | 自配  | 
Trizol  | Life Technologies  | 
Lv仿  | 國藥集團  | 
異丙醇  | 國藥集團  | 
乙醇  | 國藥集團  | 
PrimeScript® RT reagent Kit  | Takara  | 
熒光定量試劑盒  | Takara  | 
二、 實驗步驟
1、樣本處理
4℃ 12000rpm 離心收集細胞,棄上清。PBS 清洗 1 遍后,加入 1mL Trizol 充分混勻。
2、兩相分離 每個樣品中加入 0.2 mL 的lv仿,蓋緊管蓋,劇烈振蕩管體,室溫靜置 5min。4℃下 12000rpm
離心 15 min。離心后混合液體將分為下層的紅色酚lv仿相,中間層和上層的無色的水相。RNA 全部被分配于水相中。水相的體積大約是勻漿時加入的 Trizol 試劑的 60%。
3、RNA 沉淀 將水相轉(zhuǎn)移到新離心管中。加入等體積的異丙醇,水相與異丙醇混合以沉淀其中的 RNA?;靹虿⒃谑覝胤跤?10 min 后,4℃ 12000rpm 離心 10 min。
4、RNA 清洗 移去上清液,加入 1 mL 75%乙醇,清洗 RNA 沉淀。振蕩后,4℃ 7500 rpm 離心5 min。
5、重新溶解 RNA 沉淀
去除乙醇溶液,空氣中干燥 RNA 沉淀 5-10 min。溶解 RNA 時,先加入無 RNA 酶的水用槍反
復(fù)吹打幾次,然后 55 到 60℃孵育 10 min。獲得的 RNA 溶液保存于- 70℃。
6、反轉(zhuǎn)錄
1) 按下列組份配制 RT 反應(yīng)液
5×PrimeScript Buffer  | 5 μL  | 
PrimeScript® RT Enzyme Mix I  | 1 μL  | 
Oligo dT Primer(50 μM)×1  | 1 μL  | 
Random 6 mers(100 μM)×1  | 1.5 μL  | 
Total RNA  | 1 ng  | 
RNase Free ddH2O  | Up to 25 μL  | 
2)反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)條件如下: 37℃ 15min,85℃ 5s。
3)反應(yīng)結(jié)束后,將其放在冰上待用或-20℃保存。
7、熒光定量 PCR
引物設(shè)計
Gene  | Forward Primer  | Reverse Primer  | 
β-action  | 5′-TTCCAGCCCTCCTTCCTG-3′  | 5′-GCCCGACTCGTCATACTCC-3′  | 
BCL  | 5′ -CTACCGTCGTGACTTCGC -3  | 3′-CCTATTGCCTCCGACCCT-5′  | 
按下列組份配制 Realtime PCR 反應(yīng)體系
SYBR Premix Ex Taq  | 10 μL  | 
PCR Forward Primer(10μM)  | 1 μL  | 
PCR Reverse Primer(10μM)  | 1 μL  | 
cDNA 模板  | 1 μL  | 
ddH2O  | 7 μL  | 
Total  | Up to 20 μL  | 
用漩渦振蕩器將管中溶液*混合均勻,短暫低速離心。
3)點樣。將混合好的液體加入孔板中,每個樣本的每個基因保證3個復(fù)孔,點完樣之后將 PCR 板置于離心機中 2000rpm、2min,然后用錫箔紙將板包好,置于 4 度冰箱中備用。 4) PCR 反應(yīng)
Real time PCR 儀使用 ABI7500,PCR 程序已優(yōu)化 將步驟 3 中已點好樣的 PCR 板置于 Realtime PCR 儀上進行 PCR 反應(yīng):首先是預(yù)變形:95℃/10min
第二步是循環(huán)反應(yīng) 40 cycles : 95℃/15s; 60℃/45s(收集熒光) ;72℃/45s 第三步溶解曲線:95℃/15s; 60℃/1min ;95℃/15s
三、 結(jié)果與計算(采用 2 - △△ CT 法進行分析)
基因相對表達量
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